Jan Tomasz Gross jest synem Żyda i Polki, która podczas wojny uratowała mu życie. Brał udział w studenckich rozruchach w marcu 1968 r., za co został aresztowany. Po wyjściu z więzienia wraz z rodzicami wyemigrował w 1969 r. do Stanów Zjednoczonych. Tam kontynuował studia i w 1975 r. obronił doktorat z socjologii na Uniwersytecie Yale, gdzie potem przez wiele lat był wykładowcą. Wykładał także na Emory University w Atlancie, New York University, Uniwersytecie Paryskim (Nanterre), Wiedeńskim, Berkeley, Cornell, Harvarda, Stanforda, Columbia University. Obecnie jest profesorem na wydziale historii Uniwersytetu w Princeton.

Redagował "East European Politics and Societes", był teżwspółzałożycielem emigracyjnego kwartalnika "Aneks".

Jan Tomasz Gross jeszcze do końca lat 90. nie wywoływał kontrowersji w środowiskach polskich historyków. Był ceniony jako badacz okupacyjnych losów Polaków. W swoich publikacjach opisywał też przypadki, gdy denuncjatorami polskich niepodległościowców byli sympatyzujący z komunistami Żydzi ("W 40. nas matko na Sybir zesłali")

Burzę wywołały jego dwie książki "Sąsiedzi" (o pogromie w Jedwabnem) i "Strach", w których zajmuje się okolicznościami mordów Polaków na Żydach. W tej ostatniej zastanawia się nad źródłami polskiego antysemityzmu w czasie okupacji i w latach powojennych. Stawia w niej m.in. tezę, że Kościół przyzwalał na Holokaust i powojenne pogromy. Po premierze polskiego wydania "Strachu" prokuratura podjęła kontrowersyjną decyzję, by zbadać, czy należy postawić Grossowi zarzut nawoływania do waśni narodowych, ale ostatecznie odmówiła wszczęcia śledztwa.

Uzyskał doktorat z socjologii na Uniwersytecie Yale. Był stypendystą fundacji Guggenheima, Rockefellera oraz Fullbrighta.

Studiował fizykę i socjologię na Uniwersytecie Warszawskim

Publikacje

1979 - Polish society under German occupation : the Generalgouvernement, 1939-1944

1984 - W czterdziestym nas matko na Sibir zesłali..

1998 - Upiorna dekada : trzy eseje o stereotypach na temat Żydów, Polaków, Niemców i komunistów : 1939-1948

1999 - Studium zniewolenia : wybory październikowe 22 X 1939

2001- Neighbors: The Destruction of the Jewish Community in Jedwabne, Poland, Princeton University Press, 2001

2003 - Revolution from Abroad. The Soviet Conquest of Polands Western Ukraine and Western Belorussia. Princeton University Press 2003

2003 - Wokół "Sąsiadów" : polemiki i wyjaśnienia, Sejny : Pogranicze

2006 - Fear: Anti-Semitism in Poland After Auschwitz, Random House

2008 - Strach: Antysemityzm w Polsce tuż po wojnie. Historia moralnej zapaści.