Od 1976 r. sprawuje funkcje proboszcza parafii giżyckiej i wizytatora lekcji religii diecezji mazurskiej. Brał udział w życiu kulturalnym miasta, m.in. organizował koncerty organowe, na które zapraszał znanych muzyków. W swym kościele udzielał gościny grekokatolikom. Pragnie ożywić zainteresowanie wiernych religią. Dlatego w czasie wakacji polecił odprawiać nabożeństwa w Giżycku zarówno po polsku, jak i po niemiecku - dla turystów. Pastor Janusz Jagucki jest żonaty, ma córkę. W styczniu 2001 r. przejął obowiązki zwierzchnika Kościoła ewangelicko-augsburskiego w Polsce.

6 stycznia 2001 roku w Warszawie został konsekrowany na biskupa Kościoła Ewangelicko-Augsburskiego w Polsce; zastąpił na tym urzędzie ks. biskupa Jana Szarka.

Studiował teologię na Chrześcijańskiej Akademii Teologicznej (ukończył w 1970)