Był dźwigowym i spawaczem w Stoczni Szczecińskiej. W 1970 r. należał do liderów strajku zakładowego. W 1980 r. przewodniczył Międzyzakładowemu Komitetowi Strajkowemu w Szczecinie. Następnie był przewodniczącym Zarządu Regionu Pomorze Zachodnie NSZZ "Solidarność". Porozumienie z rządem podpisał dzień przed tym, jak zrobił to w Gdańsku Lech Wałęsa. Po wprowadzeniu stanu wojennego został internowany. Lata 1982-1983 spędził w więzieniu, które opuścił na mocy amnestii w 1984 roku. W latach 1987-1989 należał do Grupy Roboczej Komisji Krajowej NSZZ "Solidarność". Nie uznał porozumień okrągłego stołu, założył wówczas "Solidarność 80" (luty 1990) i stanął na jej czele.

W 1997 roku został senatorem RP IV kadencji. Rok później wybrany przez Radę Miasta Prezydentem Szczecina. 31 grudnia 1998 r., tuż po objęciu urzędu, Jurczyk zerwał umowę, którą podpisał we wrześniu 1998 r. poprzedni Zarząd Miasta Szczecina z niemiecką spółką Euroinvest Haller. Chodziło o budowę hipermarketu na Pomorzanach po wpłaceniu przez firmę 5 mln zł zaliczki. Miasto Szczecin, na podstawie wyroku sądu II instancji musiało zwrócić spółce zaliczkę i zapłacić odsetki - ponad 9,5 mln zł. W 2005 r. Jurczykowi i pozostałym sześciu członkom Zarządu Miasta prokurator przedstawił zarzut niedopełnienia obowiązków i narażenia miasta na znaczne straty materialne, za co groziło do 10 lat pozbawienia wolności. 5 lipca 2007 roku sąd I instancji wydał wyrok skazujący Jurczyka i byłego wiceprezydenta ds. rozwoju gospodarczego Dariusza Wieczorka na dwa lata pozbawienia wolności w zawieszeniu na pięć lat. Ponadto objął obu skazanych czteroletnim zakazem pełnienia stanowisk związanych z gospodarowaniem mieniem w jednostkach samorządowych i państwowych oraz nakazał im zwrócić do kasy miejskiej zapłacone przez miasto odsetki. Wyrok nie jest prawomocny, obaj skazani zapowiedzieli odwołania.

W 1999 r. Sąd Lustracyjny uznał, że Marian Jurczyk zataił informację o kontaktach ze służbami specjalnymi PRL. Stracił wówczas mandat senatora. Ostatecznie Sąd Najwyższy w 2002 r. zawyrokował, że Jurczyk nie był tajnym współpracownikiem służb bezpieczeństwa. Sama SB oceniła współpracę Jurczyka jako mało przydatną.

Po wykładni Trybunału Konstytucyjnego, który stwierdził, że funkcji prezydenta miasta nie można łączyć z mandatem senatorskim, 24 stycznia 2000 r. zrezygnował z pełnienia funkcji Prezydenta Szczecina. W listopadzie 2002 r. został nim ponownie.

23 maja 2004 r. przeprowadzono referendum w sprawie odwołania Mariana Jurczyka ze stanowiska Prezydenta Miasta Szczecina. W referendum 94 proc. głosujących było za jego odwołaniem, jednak z powodu niedostatecznej frekwencji (19 proc.) było ono nieważne.

W I turze wyborów prezydenta Szczecina w 2006 r. Jurczyk, ubiegając się po raz drugi o reelekcję, zdobył niecałe 3 proc. głosów wyborców. Urząd Prezydenta Szczecina sprawował do 4 grudnia 2006 r.