Od ponad 20 lat prowadzi prywatną działalność gospodarczą. Współwłaściciel i były prezes zarządu Ocean Company SA. Firma powstała w 1990 r., a cztery lata później zadebiutowała na rynku równoległym warszawskiej giełdy. Spółka zajmuje się handlem detalicznym i hurtowym artykułami przemysłowymi, działalnością na rynku nieruchomości i produkcją spirytusu odwodnionego. 1 marca 2000 r. Malinowski został tymczasowo aresztowany pod zarzutem działania na szkodę spółki. W tym samym dniu został odwołany z funkcji prezesa zarządu. W 1999 r. przychody firmy wyniosły 222,5 mln zł, a zysk netto - 8,8 mln zł. 31 grudnia 1999 r. Malinowski posiadał 9 650 905 akcji (64,35 proc. kapitału akcyjnego spółki) o wartości ponad 121,6 mln zł. W 2000 r. na 48. pozycji na liście 100 najbogatszych Polaków tygodnika "Wprost".