Wiktor Zubkow, uważany za człowieka prezydenta Władimira Putina, ukończył studia ekonomiczno-rolnicze w 1965 r. i odbył dwuletnią służbę wojskową. Po powrocie do "cywila" przepracował 17 lat (1967-85) w państwowych gospodarstwach rolnych (sowchozach) w obwodzie leningradzkim i doszedł do stanowiska dyrektora generalnego zjednoczenia sowchozów "Pierwomajskoje".
Od 1985 do 1991 roku wspinał się po szczeblach karierę w aparacie Komunistycznej Partii Związku Radzieckiego w obwodzie leningradzkim, kończąc ją na szczeblu pierwszego wiceprzewodniczącego Komitetu Wykonawczego partii w tym obwodzie. Kolejne dwa lata był wiceprzewodniczącym Komisji Spraw Zagranicznych w Urzędzie Miejskim w Petersburgu i podwładnym Władimira Putina, który stał na czele tego czele tego komitetu.
W 1993 roku przeszedł do pracy w aparacie skarbowym. Zaczynał od funkcji szefa inspekcji podatkowej w Petersburgu, by sześć lat później w 1999 roku zostać wiceministrem ds. podatków dla regionu północno-zachodniego, obejmującego Sankt Petersburg i obwód leningradzki. We wrześniu 1999 r. Zubkow bez powodzenia (8,64 proc. poparcia) wystartował wyborach na gubernatora Obwodu Leningradzkiego, mimo że był wspierany przez Borysa Gryzłowa, wówczas szefa proprezydenckiego ruchu "Jedność".
Od 2001 roku Zubkow kierował Federalną Służbą Monitoringu Finansowego, czyli wywiadem finansowym, powołanym do monitorowania przepływu gotówki oraz walki z praniem brudnych pieniędzy.
12 września 2007 po niespodziewanej dymisji gabinetu dotychczasowego premiera Michaiła Fradkowa, prezydent Władimir Putin desygnował Zubkowa na jego miejsce. Dwa dni później tę kandydaturę zaaprobowała Duma Państwowa. Nie wykluczał startu w wyborach prezydenckich 2008 roku, ostatecznie nie zdecydował sie na kandydowanie.
7 maja 2008 złożył dymisję z urzędu premiera na ręce nowo zaprzysiężonego prezydenta Rosji Dmitrija Miedwiediewa. Następnego dnia obowiązki szefa rządu przejął Władimir Putin. Zubkow znalazł się w nowo utworzonym rządzie Putina obejmując stanowisko pierwszego wicepremiera.

Córka Zubkowa jest żoną ministra obrony Rosji Anatolija Serdiukowa.

Ukończył Instytut Rolniczy w Leningradzie jako "agronom- ekonomista".